2）对原生动物的灭活效果
二氧化氯对原生动物有较强的灭活能力，但具体的灭活效果取决于原生动物的类型和消毒条件，下面以危害较大的两虫作为重点加以阐述。
对于相对较容易灭活的贾弟虫，二氧化氯对它的灭活性能优于液氯。根据Hofmann等人的研究结果，在水温1~25摄氏度、PH=6~9的水质条件和接触时间60min的消毒条件下，1.5~2.0mg/l的二氧化氯即可对贾第虫达到 3log灭活。
隐孢子虫对二氧化氯的耐受性一般比贾第虫强8~16倍。尽管隐孢子虫难于灭活，但在一定的消毒条件之下，二氧化氯仍能对其进行有效灭活。有研究结果显示，采用0.22mg/l的二氧化氯进行消毒30min,即可明显降低隐孢子虫的活性。进一步的研究表明，灭活隐孢子虫所需的二氧化氯的CT值变化较大，它主要取决于水样中隐孢子虫的浓度和相关的水质条件（如水温、PH值）。如Korich等人得出的结论是：为实现对隐孢子虫的1~1.5log灭活，二氧化氯的CT值须在60~80mg.min/l范围内。Finch等人报道，为实现隐孢子虫的1log灭活，二氧化氯的CT值 须在27~30mg.min/l；如果对隐孢子虫达到 2log和3log灭活，二氧化氯的CT值大约为40 mg.min/l和70 mg.min/l左右。此外，Finch等人还发现，在水温22摄氏度、PH=8.0的水质条件和二氧化氯初始残余量2.7~3.3mg/l的情况下，30min后即可达到对隐孢子虫的3log灭活。
除两虫以外，大量的研究结果还表明，二氧化氯也是灭活孢子、带鞭毛类微生物的良好消毒剂，在同等条件下的灭活效果优于液氯、至少是与液氯相当。在高PH值 的水质条件下，二氧化氯对它们的灭活效果明显优于液氯。表6和表7列出了不同环境条件下灭活肠伯氏鞭毛虫所需的二氧化氯的CT值。从表6~表7可见，在PH=6~9的范围内，为达到相同的灭活效果，当水温从0.5摄氏度增加到25摄氏度时，所需的二氧化氯CT值不断降低；而在PH=6~9、水温相同的情况下，达到1log灭活所需的二氧化氯CT值一般为0.5log灭活的对应值的一半左右。

                 表 6 肠伯氏鞭毛虫0.5log灭活的CT值/(mg.min/l)

消毒剂	PH值	不同水温（摄氏度）下，所需二氧化氯CT值
		0.5	5	10	15	25
二氧化氯 臭氧 液氯 液氯 液氯 液氯 氯胺	6~9 6~9 6 7 8 9 6~9	10 0.48 25 35 51 73 635	4.3 0.32 18 25 36 52 365	4 0.23 13 19 27 39 310	3.2 0.16 9 13 18 26 250	2 0.08 4 6 9 13 125

表7肠伯氏鞭毛虫1log灭活的CT值/(mg.min/l)

消毒剂	PH值	不同水温（摄氏度）下，所需二氧化氯CT值
		0.5	5	10	15	25
二氧化氯 臭氧 液氯 液氯 液氯 液氯 氯胺	6~9 6~9 6 7 8 9 6~9	21 0.97 49 70 101 146 1270	8.7 0.63 35 50 72 104 735	7.7 0.48 26 37 54 78 615	6.3 0.32 18 25 36 52 500	3.7 0.16 9 12 18 26 250

（3）对病毒的灭活效果
早在1946年就有二氧化氯灭活脊髓灰质炎病毒的报道，如今各种研究结果反复证实二氧化氯是一种有效的病毒灭活剂。据报道，二氧化氯对f2病毒（反映消毒效果的指标病毒）的灭活作用强于氯和溴合剂，以5.0mg/l二氧化氯作用30s或以7.5mg/l作用20s,可对f2病毒达到4log~5log以上的灭活。用0.15mg/l二氧化氯作用10min或2.0mg/l作用1min,均可将f2病毒完全杀灭。浓度2000mg/l二氧化氯作用15min,1000mg/l作用20min或500mg/l作用30min可将肝炎HbsAg抗原完全破坏。
二氧化氯对不同病毒的灭活效果不尽相同，并且它对病毒单体的灭活效果优于病毒聚集体。例如，二氧化氯与液氯对某些病毒的灭活效果差别不大，如脊髓灰质炎1号病毒和柯萨奇A9病毒。此外，体系PH值对二氧化氯灭活病毒的效果影响较大，一般在偏碱性条件下，二氧化氯对多数病毒的灭活效果优于液氯，如艾柯7号病毒、柯萨奇B3病毒和仙台病毒。